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EML4-ALK V1 [G1202R]/BaF3

CBP73200

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I. Background
      棘皮微管相關蛋白(Echinoderm microtubule-associated protein,EMAP)在海膽中表達, 是第一個被鑒定的 EMAP 樣蛋白(EML)家族成員。它是海膽卵微管(MT)制劑的主要成分, 也被發(fā)現在間期和有絲分裂時與微管蛋白共定位。

      ALK 是胰島素受體超家族的一員,首次在間變性大細胞淋巴瘤中通過與核磷蛋白 (NPM)融合發(fā)現。癌細胞中的 ALK 信號傳導通過三種主要機制發(fā)生:基因融合、基因 擴增和點突變。

      在肺癌中檢測到的第一個致癌融合是 EML4-ALK,由 2 號染色體短臂上的一個小倒位 產生,促進 EML4 N 末端與 ALK(外顯子 20)的融合。一旦 EML4 中的斷點出現在不同 的外顯子(2、6、13、14、15、18 和 20)中,EML4-ALK 融合蛋白就會呈現多種變體。 其中 EML4-ALK 融合中最常見的變體亞型為 V1 和 V3a/b,約占所有 EML4-ALK 融合突變 的 70%。不同 EML4-ALK 變體的表達可能會影響對 ALK TKI 的反應,從而影響繼發(fā)性耐 藥特異性 ALK 突變的發(fā)展傾向。EML4 與 ALK 激酶結構域的融合導致異常信號傳導,從 而增加細胞生長、增殖和細胞存活。在 NSCLC 患者的 ALK 中檢測到的點突變約占觀察到 的耐藥機制的三分之一,其中最常見的是 p.L1196M(類似于 EGFR 的 p.T790M)。其他確 定的突變有 p.1151Tins、p.L1152R、p.C1156Y、p.I1171T、p.F1174L、p.V1180L、p.G1202R、 p.D1203N、p.S1206Y 和 p.G1269A 。這些突變增加了酪氨酸激酶受體與 ATP 的親和力,降 低了 TKI 的結合親和力。ALK 基因突變,例如 p.1151Tins 和 p.G1202R,導致對第二代 ALK TKI 產生耐藥性;p.L1196M 和 p.L1152R 賦予對第二代和第三代 ALK TKI 的敏感性; p.G1202R 導致對第一代和第二代 ALK TKI 產生耐藥性。
 
II. Description
      BaF3(小鼠原 B 細胞)的生長和增殖需要 IL-3 的維持。通過引入各種表達激酶的基因, 能作為 BaF3 的驅動基因,讓 BaF3 不再依賴 IL-3 而增殖,進而激酶基因成為 BaF3 增殖依 賴的驅動基因,用于評估小分子藥物對激酶的靶向抑制作用,原理及流程見下圖所示。
 


Figure 1. 
EML4-ALK V1 [G1202R] BaF3 細胞的構建原理圖
 
III. Introduction
Cell Line Name: EML4-ALK V1 [G1202R]/BaF3
Host Cell: Ba/F3
Stability: 16 passages (in-house test, that not means the cell line will be instable beyond the passages we tested.)
Application: Anti-proliferation assay and PD assay
Freeze Medium: 90% FBS+10% DMSO
Complete Culture Medium: RPMI-1640+10%FBS
Mycoplasma Status: Negative
 
IV. Representative Data

1.WB of  EML4-ALK V1 G1202R/BaF3

Figure 2. WB of  EML4-ALK V1 G1202R/BaF3.

2. Sanger Sequencing of EML4-ALK v1 Fusion

Figure 3. Sanger sequencing of EML4-ALK v1 Fusion

Figure 4. Sanger sequencing of ALK v1 G1202R (c.3604G>A)

3. Anti-proliferation assay

Figure 5. CCK8 Proliferation Assay of EML4-ALK v1 [G1202R] BaF3(C5).

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